Tudi robustne čebulice niso prizanesene pred boleznimi in škodljivci. S spretno izbiro lokacije in sosedov v postelji lahko preprečimo okužbo.

Napačna plesen
Peronospora je najpogostejša glivična bolezen čebule, ki se lahko pojavi v vztrajno vlažnem in hladnem vremenu. Spore glive prenašajo obolele čebulice ali pa izhajajo iz zemlje, kjer ostanejo od prezimljenih rastlin.
Klinična slika se kaže v tem, da listje spremeni barvo. Vendar je razbarvanje sprva težko opaziti, tako da se lahko neovirano širi. Če okužba napreduje, listi odmrejo in gomolj težko raste.
Preventivni ukrepi:
- Pri nakupu semena bodite pozorni na odporne sorte
- rastline po možnosti zalivajte zjutraj ali popoldan, da vlaga ne pride čez noč na liste
- pomemben je zračen vrtni prostor
- ne razporedite vrst pretesno, da bodo imele rastline več prostora
čebulna muha
Čebulna muha je agresiven škodljivec, ki od aprila odloži jajčeca na mlade rastline. Črvi, ki se izležejo iz nje, poškodujejo čebulo, tako da jo zaužijejo. Čebulna muha se izleže dva do trikrat na leto. Prva generacija je najbolj nevarna, ker se mlade sadike šele razvijajo in niso dovolj robustne.
Okužbo prepoznate po tem, da mlade rastline najprej ovenejo, nato pa se njihova zelena posuši. Čebula začne gniti. To opazite predvsem po tem, da čebulo zlahka izvlečete iz zemlje.
Najboljši način, da se izognete okužbi z muhami, je uporaba zaščitnih mrež, napetih čez ležišča. To je še posebej pomembno v obdobju od setve v aprilu do oblikovanja gomoljev v juniju, saj rastoče sadike v tem trenutku še niso odporne. Ugodno bi morala vplivati tudi neposredna bližina korenja. Poleg tega ne smemo pretiravati s svežim organskim gnojilom.
namigi in triki
Čebuli je prihranjen en nadležen škodljivec: polži čebule ne marajo, verjetno je zanje prepekoča.